Al llarg dels anys, el Handbook of the Birds of the World, Lynx Edicions i en Josep del Hoyo, editor de la col·lecció, han estat guardonats amb nombrosos premis d’institucions i publicacions internacionals.

  • HBW Vol. 1: Bird Book of the Year 1992 – Birdwatch.
  • HBW Vol. 1: Best Bird Book of the Year 1993 British Birds/British Trust for Ornithology.
  • HBW Vol. 5: Outstanding Academic Title 2000 – ‘Choice: Current Reviews for Academic Libraries’. Publicació dedicada a ressenyar les novetats editorials per a les biblioteques universitàries nordamericanes.
  • Lynx Edicions: Premi de la Generalitat de Catalunya a la Internacionalització de l’Economia Catalana 2002, per la seva contribució a la internacionalització de l’economía catalana amb el projecte del HBW.
  • HBW Vol. 7: Best Bird Book of the Year 2002British Birds/British Trust for Ornithology.
  • HBW Vol. 7: Best Bird Reference Book 2002WorldTwitch.
  • HBW Vol. 8: Best Bird Reference Book 2003WorldTwitch.
  • HBW Vol. 9: Best Bird Reference Book 2004WorldTwitch.
  • Josep del Hoyo: 2010 – El seu cognom va ser triat pel taxònom alemany Norbert Bahr per descriure el taxó Buteo albicollis delhoyoi, “per tal d’honrar a l’ornitòleg espanyol Josep del Hoyo, iniciador i editor del monumental i magnífic Handbook of the Birds of the World, per la seva excel·lent contribució a la conservació dels ocells i la ciència ornitològica.”
  • Josep del Hoyo: Premi Fundación BBVA 2010 a la Difusió del coneixement i sensibilització en la conservació de la biodiversitat 2010.
  • Trogons. A Natural History of the Trogonidae: Guanyador a la categoria de Millor maquetació (Best Interior Design) dels 2010 International Book Awards; Finalista a la categoria de Millor disseny de portada (Best Cover Design) dels 2010 International Book Awards.
  • Lynx Edicions: Premi a la Divulgació de la Natura 2011, Asociación para el Estudio, Divulgación y Conservación de la Naturaleza Fundación Omacha (EDC NATURA).
  • Josep del Hoyo: Premio Bernis a la Trayectoria Personal 2012. “Coincidint amb la finalització de la gran obra enciclopèdica Handbook of the Birds of the World, SEO / BirdLife ha expressat el seu agraïment i admiració a l’editor principal d’aquesta gran publicació, Josep del Hoyo, atorgant-li el Premi Francisco Bernis d’Ornitologia en la modalitat de millor Trajectòria Personal”.
  • HBW Special Volume: New Species and Global Index: Outstanding Academic Title 2014 – ‘Choice: Current Reviews for Academic Libraries’.
  • Josep del Hoyo: SGE- Sociedad Geográfica Española. Premio a la Investigación 2014. El premi “SGE Investigación” s’otorga a la persona o entitat que més s’ha distingit per la seva perseverància en tasques d’investigació o divulgació.
  • HMW Vol.5: Guanyador de la  Whitley Medal 2016. Els premis Whitley Awards es concedeixen a les millors obres sobre avifauna australiana que han estat publicades en els darrers 12 mesos. Són els premis més prestigiosos que s’atorguen a publicacions destacades sobre l’avifauna australiana.
  • Birds of New Guinea: Guardonat en els Whitley Awards de 2017: “Certificate of Commendation” al millor llibre en la categoria de GUIES DE CAMP.
  • HMW Vol.9: Bats: Outstanding Academic Title 2020– ‘Choice: Current Reviews for Academic Libraries’.
  • Josep del Hoyo: 2022 – El seu cognom va ser triat per descriure el taxó Apaloderma camerunense delhoyoi, amb el següent comentari dels autors de l’article: “En concebre, crear i editar l’incomparable i immens Handbook of the birds of the world (1992‒2013), en Josep del Hoyo va realitzar una de les majors contribucions a l’ornitologia mundial de qualsevol individu.”